拥有61年历史的上海市中医文献馆是上海唯一一个以中医文献研究为主要研究方向的机构，肩负着把传统文献融入中医发展新时代潮流中的重任。
1956年建馆之初，上海市中医文献馆聘任62位名老中医为馆员，1981年又第二批聘任了32位当时的上海市名老中医，最近一次则是在2013年，聘任了32位馆员和3位名誉馆员。多年来，张镜人、裘沛然、颜德馨、石仰山、朱南孙等国医大师及诸多上海知名专家云集于此。通过馆员制的方式，名老中医的学术经验、成才之路和临床优势得以传承、发展、创新。
在对馆藏文献的收集、整理和发掘过程中，上海市中医文献馆还将具有重要历史地位的海派中医流派作为文献研究的中心内容，并通过师承教育等方式，更好地为上海居民服务。

上海市中医文献馆以科研为主，同时兼有教学和临床任务。
中医药大学以及开设相关课程的学校，其主要任务是“教”——培养学生的临床基础，医院的重点则放在“医”——临床的诊疗和服务上，上海市中医文献馆则将这两个功能相结合。
学术研究、文献著作最终要变成老百姓实际的疗效，对社会发展产生直接的作用，为此，上海市中医文献馆设立中医特色门诊部，用临床实践的形式，来传承和发扬上海海派中医名家的学术经验。
门诊部只提供中药饮片、针灸、推拿等传统中医服务，在上海公立医疗机构中极具特色。

近几年，上海市中医文献馆的发展进入了新时期。今年，在原有工作基础上，文献馆提出开放办馆，其中，尤其注重中医药文化的传播。在原有中医文献杂志社的基础上，文献馆整合馆内优质资源，新成立中医药文化传播研究中心，探索中医药文化传播路径。
2017年9月中旬到11月中旬，海派中医专列“现身”上海地铁2号线、10号线，直接面向年轻人传播中医药文化。与此同时，取材于馆长本人亲身经历的海派中医宣传片《同舟共济》在网络上引发热烈反响。
上海市中医文献馆正在朝着“让年轻人了解中医、喜爱中医、使用中医、信任中医”的重要工作目标一步步迈进。

传承、发展、创新是中医药事业永恒的话题。
首先是要在浩如烟海的中医文献中，把中医药的精华凝练出来，特别是基于上海本地的海派中医特色。
其次是要和上海的社会经济发展相适应，将传统中医药和上海的创新发展结合好。上海市中医文献馆把中小学生的中医药文化传播作为下阶段工作的重点，将选择孩子们喜闻乐见的方式，让他们成为中医的粉丝，进而去影响他们的家庭。
再者，文献馆计划和部分文化名人开展交流，探讨在上海传播中医药文化的有效路径。
此外，文献馆还将进一步深入社区、发掘社区居民，分享中医养生保健知识与方法，带动社会对中医的认可。